BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB025A02LP1|AL428304
(898 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig577 1780 0.0
3x_Contig1805 1606 0.0
>3x_Contig577
Length = 1642
Score = 1780 bits (898), Expect = 0.0
Identities = 898/898 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 aagatccaaaaattgtggtgagatatctgctttttagtatgggggtggtcaatatggaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1530 aagatccaaaaattgtggtgagatatctgctttttagtatgggggtggtcaatatggaag 1471
Query: 61 aataaacgtctgacccgtacatatctgtgtgtggatcatacgggaacggtatcgtatgtg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1470 aataaacgtctgacccgtacatatctgtgtgtggatcatacgggaacggtatcgtatgtg 1411
Query: 121 aataattagggtcctactcccttttatgccgagatttaaaaatagacagcggtaaagatc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1410 aataattagggtcctactcccttttatgccgagatttaaaaatagacagcggtaaagatc 1351
Query: 181 cccattagtcctccaagagacaaattaataggacccttacttggatctcatgattttcta 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1350 cccattagtcctccaagagacaaattaataggacccttacttggatctcatgattttcta 1291
Query: 241 catggtttacatatataaagatattatgagaggaagtttatgtcggcgaatcagtaggat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1290 catggtttacatatataaagatattatgagaggaagtttatgtcggcgaatcagtaggat 1231
Query: 301 tttaatttggtttagtagcagattatttcaattggattgttgaaataaagtatttagaac 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1230 tttaatttggtttagtagcagattatttcaattggattgttgaaataaagtatttagaac 1171
Query: 361 caacagttcttacaacaattgaagatgctcgctaaaactttggctttgttattctttgcc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1170 caacagttcttacaacaattgaagatgctcgctaaaactttggctttgttattctttgcc 1111
Query: 421 gtgcaaacttgcgttagggcccaaagtctcgaagttccgcaagtcgaacctattaccact 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1110 gtgcaaacttgcgttagggcccaaagtctcgaagttccgcaagtcgaacctattaccact 1051
Query: 481 gaaaccactgtattctcgagaggaccgggacagatcactacaacttattccacggaagtt 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1050 gaaaccactgtattctcgagaggaccgggacagatcactacaacttattccacggaagtt 991
Query: 541 gtgactgacgatggcaccattccaaccgttatgactatctactatgtccagatcccttat 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 990 gtgactgacgatggcaccattccaaccgttatgactatctactatgtccagatcccttat 931
Query: 601 tttgatgatgacgattatgttactgaggagaccatcgtgaccactgaatacacagtgtgg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 930 tttgatgatgacgattatgttactgaggagaccatcgtgaccactgaatacacagtgtgg 871
Query: 661 acaggcacttatactactacatattccactgaggttttgactctaagcggtggccctata 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 870 acaggcacttatactactacatattccactgaggttttgactctaagcggtggccctata 811
Query: 721 ccgactgttaaaaccatttacaaggtgcagaccccagacacgtcagatgatggcggggat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 810 ccgactgttaaaaccatttacaaggtgcagaccccagacacgtcagatgatggcggggat 751
Query: 781 gatggcactgaaaccacgaccaccactgaaaccacagagtatactgtatggactggaacg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 750 gatggcactgaaaccacgaccaccactgaaaccacagagtatactgtatggactggaacg 691
Query: 841 tacaccaccacttattctaccgatgtgctatctgaaaccggtgatgatggtatcgcta 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 690 tacaccaccacttattctaccgatgtgctatctgaaaccggtgatgatggtatcgcta 633
>3x_Contig1805
Length = 19369
Score = 1606 bits (810), Expect = 0.0
Identities = 876/898 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 aagatccaaaaattgtggtgagatatctgctttttagtatgggggtggtcaatatggaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 aagatccaaaaattgtggtgagatatctgctttttagtatgggggtggtcaatatggaag 401
Query: 61 aataaacgtctgacccgtacatatctgtgtgtggatcatacgggaacggtatcgtatgtg 120
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 aataaatgtctgacccgtacatatctgtgtgtggatcatacgggaacggtatcgtatgtg 461
Query: 121 aataattagggtcctactcccttttatgccgagatttaaaaatagacagcggtaaagatc 180
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||
Sbjct: 462 aataattagggtcctgctcccttttatgccgagatttaacaataggcagtggtaaagatc 521
Query: 181 cccattagtcctccaagagacaaattaataggacccttacttggatctcatgattttcta 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 522 cccattagtcctccaagagacaaattaataggacccttacttagatctcatgattttcta 581
Query: 241 catggtttacatatataaagatattatgagaggaagtttatgtcggcgaatcagtaggat 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 582 catggtttacatatataaagatattatgagaggaagattatgtcggtgaatcagtaggat 641
Query: 301 tttaatttggtttagtagcagattatttcaattggattgttgaaataaagtatttagaac 360
| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 642 tctaatttggtttagtatgagaatatttcaattggattgttgaaataaagtatttagaac 701
Query: 361 caacagttcttacaacaattgaagatgctcgctaaaactttggctttgttattctttgcc 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 702 caacagttcttacaacaattgaagatgctcgctaaaactttggctttgttattcttagcc 761
Query: 421 gtgcaaacttgcgttagggcccaaagtctcgaagttccgcaagtcgaacctattaccact 480
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 762 gtgccaacttgcgttagggcccaaagtctcgaagttccgcaagtcgaacctattaccact 821
Query: 481 gaaaccactgtattctcgagaggaccgggacagatcactacaacttattccacggaagtt 540
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 822 gaaaccactgtattctcgagaggaccgggacaaatcactacaacttattccacggaagtt 881
Query: 541 gtgactgacgatggcaccattccaaccgttatgactatctactatgtccagatcccttat 600
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 882 gtgactgacgatggcactattccaactgttatgactatctactatgtccagatcccgtat 941
Query: 601 tttgatgatgacgattatgttactgaggagaccatcgtgaccactgaatacacagtgtgg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 942 tttgatgatgacgattatgttactgaggagaccatcgtgaccactgaatacacagcgtgg 1001
Query: 661 acaggcacttatactactacatattccactgaggttttgactctaagcggtggccctata 720
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1002 acaggcacttatactactacgtattccactgaggttttgactctaagcggtagccctata 1061
Query: 721 ccgactgttaaaaccatttacaaggtgcagaccccagacacgtcagatgatggcggggat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1062 ccgactgttaaaaccatttacaaggtgcagaccccagacacgtcagatgatggcggggat 1121
Query: 781 gatggcactgaaaccacgaccaccactgaaaccacagagtatactgtatggactggaacg 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1122 gatggcactgaaaccacgaccaccactgaaaccacagagtatactgtatggactggaacg 1181
Query: 841 tacaccaccacttattctaccgatgtgctatctgaaaccggtgatgatggtatcgcta 898
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1182 tacaccaccacttattctaccgatgtgctaactgaaaccggtgatgatggtatcgcta 1239
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 5652
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 5652
Number of successful extensions: 40
Number of sequences better than 1.0e-20: 2
length of query: 898
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 882
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 9110741598
effective search space used: 9110741598
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.6 bits)